这项研究借此确认一种可以计算食管结节细胞会胃癌(ESCC)患者总体预后(OS)的miRNAs表单。
从NCBI GEO获119名ESCC患者的miRNA表达对光及其相应的诊疗信息,并将其作为锻炼集。在一时期和中后期样本有数筛选差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归分析方法、递归构造消除(RFE)-支持向量座机(SVM)算法和LASSO Cox回归模型来识别预后普遍性miRNAs,从而设立预后低分模型。此外,计算了这些预后普遍性miRNAs的有前途靶遗传,然后构建了miRNA靶遗传网络。通过功用钼分析方法,分析方法了ESCC中这些预后普遍性miRNAs计算靶遗传的功用一致普遍性。
在锻炼集中,一时期与中后期样本有46个DEmiRNAs。设立了基于5个miRNAs的不确认普遍性低分模型。该5-miRNA不确认普遍性低分可以将锻炼集分为OS时有数明显不同的高危组和低危组。在一个来自胃癌症DNA图对光(TCGA)的独立样本集中,获得成功验证了5-miRNA不确认普遍性低分的不确认普遍性分层能力也。已确认了与这些miRNAs相关的各种生物学过程和自营,例如Wnt信号自营、TRP通道的炎症介质调节自营和雌激素信号自营。
这项研究提示,与病理分段相关的5-miRNA表单对计算ESCC患者的预后具有诊疗意义。
原始出处:
JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.
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